Protein–RNA interactions for Protein: Q5T3J3

LRIF1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIF1Q5T3J3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRIF1Q5T3J3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms