Protein–RNA interactions for Protein: Q5R3I4

TTC38, Tetratricopeptide repeat protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC38Q5R3I4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC38Q5R3I4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC38Q5R3I4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC38Q5R3I4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC38Q5R3I4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC38Q5R3I4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC38Q5R3I4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC38Q5R3I4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC38Q5R3I4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC38Q5R3I4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC38Q5R3I4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC38Q5R3I4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC38Q5R3I4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC38Q5R3I4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC38Q5R3I4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC38Q5R3I4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC38Q5R3I4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC38Q5R3I4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC38Q5R3I4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC38Q5R3I4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC38Q5R3I4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC38Q5R3I4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC38Q5R3I4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC38Q5R3I4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC38Q5R3I4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC38Q5R3I4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC38Q5R3I4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC38Q5R3I4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC38Q5R3I4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC38Q5R3I4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC38Q5R3I4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC38Q5R3I4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms