Protein–RNA interactions for Protein: Q5MAI5

CDKL4, Cyclin-dependent kinase-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL4Q5MAI5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDKL4Q5MAI5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDKL4Q5MAI5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDKL4Q5MAI5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDKL4Q5MAI5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDKL4Q5MAI5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDKL4Q5MAI5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKL4Q5MAI5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKL4Q5MAI5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKL4Q5MAI5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKL4Q5MAI5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKL4Q5MAI5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKL4Q5MAI5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKL4Q5MAI5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKL4Q5MAI5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDKL4Q5MAI5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDKL4Q5MAI5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKL4Q5MAI5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKL4Q5MAI5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKL4Q5MAI5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKL4Q5MAI5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKL4Q5MAI5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKL4Q5MAI5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKL4Q5MAI5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKL4Q5MAI5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKL4Q5MAI5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKL4Q5MAI5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKL4Q5MAI5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKL4Q5MAI5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKL4Q5MAI5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKL4Q5MAI5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKL4Q5MAI5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKL4Q5MAI5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKL4Q5MAI5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKL4Q5MAI5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKL4Q5MAI5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKL4Q5MAI5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKL4Q5MAI5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKL4Q5MAI5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKL4Q5MAI5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKL4Q5MAI5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKL4Q5MAI5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKL4Q5MAI5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKL4Q5MAI5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKL4Q5MAI5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKL4Q5MAI5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKL4Q5MAI5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKL4Q5MAI5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKL4Q5MAI5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKL4Q5MAI5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKL4Q5MAI5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKL4Q5MAI5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKL4Q5MAI5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKL4Q5MAI5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKL4Q5MAI5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKL4Q5MAI5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKL4Q5MAI5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms