Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC27A3Q5K4L6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC27A3Q5K4L6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC27A3Q5K4L6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC27A3Q5K4L6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC27A3Q5K4L6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC27A3Q5K4L6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC27A3Q5K4L6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC27A3Q5K4L6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC27A3Q5K4L6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC27A3Q5K4L6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC27A3Q5K4L6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC27A3Q5K4L6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC27A3Q5K4L6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC27A3Q5K4L6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC27A3Q5K4L6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC27A3Q5K4L6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC27A3Q5K4L6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC27A3Q5K4L6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC27A3Q5K4L6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC27A3Q5K4L6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC27A3Q5K4L6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC27A3Q5K4L6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC27A3Q5K4L6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
SLC27A3Q5K4L6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
SLC27A3Q5K4L6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC27A3Q5K4L6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC27A3Q5K4L6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC27A3Q5K4L6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC27A3Q5K4L6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC27A3Q5K4L6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC27A3Q5K4L6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC27A3Q5K4L6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC27A3Q5K4L6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC27A3Q5K4L6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC27A3Q5K4L6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC27A3Q5K4L6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC27A3Q5K4L6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC27A3Q5K4L6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC27A3Q5K4L6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC27A3Q5K4L6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC27A3Q5K4L6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC27A3Q5K4L6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC27A3Q5K4L6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC27A3Q5K4L6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC27A3Q5K4L6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC27A3Q5K4L6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC27A3Q5K4L6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC27A3Q5K4L6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC27A3Q5K4L6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC27A3Q5K4L6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC27A3Q5K4L6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC27A3Q5K4L6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC27A3Q5K4L6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC27A3Q5K4L6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC27A3Q5K4L6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC27A3Q5K4L6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC27A3Q5K4L6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SLC27A3Q5K4L6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SLC27A3Q5K4L6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SLC27A3Q5K4L6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SLC27A3Q5K4L6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC27A3Q5K4L6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC27A3Q5K4L6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC27A3Q5K4L6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC27A3Q5K4L6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC27A3Q5K4L6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC27A3Q5K4L6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC27A3Q5K4L6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC27A3Q5K4L6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC27A3Q5K4L6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC27A3Q5K4L6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC27A3Q5K4L6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC27A3Q5K4L6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC27A3Q5K4L6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC27A3Q5K4L6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC27A3Q5K4L6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC27A3Q5K4L6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC27A3Q5K4L6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC27A3Q5K4L6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC27A3Q5K4L6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC27A3Q5K4L6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC27A3Q5K4L6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC27A3Q5K4L6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC27A3Q5K4L6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC27A3Q5K4L6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC27A3Q5K4L6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC27A3Q5K4L6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC27A3Q5K4L6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC27A3Q5K4L6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC27A3Q5K4L6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC27A3Q5K4L6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC27A3Q5K4L6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC27A3Q5K4L6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC27A3Q5K4L6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC27A3Q5K4L6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC27A3Q5K4L6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC27A3Q5K4L6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC27A3Q5K4L6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC27A3Q5K4L6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms