Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HABP4Q5JVS0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HABP4Q5JVS0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HABP4Q5JVS0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HABP4Q5JVS0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HABP4Q5JVS0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HABP4Q5JVS0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HABP4Q5JVS0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HABP4Q5JVS0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HABP4Q5JVS0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HABP4Q5JVS0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HABP4Q5JVS0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HABP4Q5JVS0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HABP4Q5JVS0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HABP4Q5JVS0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HABP4Q5JVS0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HABP4Q5JVS0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HABP4Q5JVS0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HABP4Q5JVS0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HABP4Q5JVS0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HABP4Q5JVS0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HABP4Q5JVS0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HABP4Q5JVS0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HABP4Q5JVS0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HABP4Q5JVS0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HABP4Q5JVS0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HABP4Q5JVS0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
HABP4Q5JVS0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HABP4Q5JVS0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HABP4Q5JVS0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HABP4Q5JVS0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
HABP4Q5JVS0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HABP4Q5JVS0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HABP4Q5JVS0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HABP4Q5JVS0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HABP4Q5JVS0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HABP4Q5JVS0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HABP4Q5JVS0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HABP4Q5JVS0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HABP4Q5JVS0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HABP4Q5JVS0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HABP4Q5JVS0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HABP4Q5JVS0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HABP4Q5JVS0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HABP4Q5JVS0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HABP4Q5JVS0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HABP4Q5JVS0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HABP4Q5JVS0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HABP4Q5JVS0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HABP4Q5JVS0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HABP4Q5JVS0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HABP4Q5JVS0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HABP4Q5JVS0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HABP4Q5JVS0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HABP4Q5JVS0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HABP4Q5JVS0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HABP4Q5JVS0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HABP4Q5JVS0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HABP4Q5JVS0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HABP4Q5JVS0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HABP4Q5JVS0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HABP4Q5JVS0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HABP4Q5JVS0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HABP4Q5JVS0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HABP4Q5JVS0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HABP4Q5JVS0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HABP4Q5JVS0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HABP4Q5JVS0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HABP4Q5JVS0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HABP4Q5JVS0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HABP4Q5JVS0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HABP4Q5JVS0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HABP4Q5JVS0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HABP4Q5JVS0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HABP4Q5JVS0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HABP4Q5JVS0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HABP4Q5JVS0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HABP4Q5JVS0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HABP4Q5JVS0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HABP4Q5JVS0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HABP4Q5JVS0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HABP4Q5JVS0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HABP4Q5JVS0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HABP4Q5JVS0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HABP4Q5JVS0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HABP4Q5JVS0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HABP4Q5JVS0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HABP4Q5JVS0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HABP4Q5JVS0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HABP4Q5JVS0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HABP4Q5JVS0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HABP4Q5JVS0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HABP4Q5JVS0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HABP4Q5JVS0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HABP4Q5JVS0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HABP4Q5JVS0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HABP4Q5JVS0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HABP4Q5JVS0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HABP4Q5JVS0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HABP4Q5JVS0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms