Protein–RNA interactions for Protein: Q562F6

SGO2, Shugoshin 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO2Q562F6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGO2Q562F6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SGO2Q562F6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGO2Q562F6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SGO2Q562F6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGO2Q562F6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGO2Q562F6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGO2Q562F6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGO2Q562F6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGO2Q562F6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGO2Q562F6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGO2Q562F6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SGO2Q562F6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGO2Q562F6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SGO2Q562F6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGO2Q562F6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGO2Q562F6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGO2Q562F6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGO2Q562F6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGO2Q562F6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGO2Q562F6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGO2Q562F6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGO2Q562F6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGO2Q562F6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGO2Q562F6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGO2Q562F6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGO2Q562F6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SGO2Q562F6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SGO2Q562F6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SGO2Q562F6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SGO2Q562F6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGO2Q562F6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGO2Q562F6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGO2Q562F6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGO2Q562F6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGO2Q562F6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms