Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTC1Q2NKJ3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms