Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RFX7Q2KHR2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RFX7Q2KHR2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RFX7Q2KHR2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RFX7Q2KHR2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RFX7Q2KHR2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RFX7Q2KHR2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RFX7Q2KHR2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RFX7Q2KHR2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RFX7Q2KHR2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RFX7Q2KHR2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RFX7Q2KHR2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RFX7Q2KHR2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RFX7Q2KHR2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RFX7Q2KHR2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RFX7Q2KHR2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RFX7Q2KHR2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RFX7Q2KHR2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RFX7Q2KHR2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RFX7Q2KHR2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RFX7Q2KHR2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RFX7Q2KHR2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RFX7Q2KHR2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RFX7Q2KHR2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RFX7Q2KHR2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RFX7Q2KHR2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RFX7Q2KHR2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RFX7Q2KHR2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RFX7Q2KHR2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RFX7Q2KHR2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RFX7Q2KHR2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RFX7Q2KHR2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RFX7Q2KHR2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RFX7Q2KHR2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RFX7Q2KHR2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RFX7Q2KHR2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RFX7Q2KHR2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RFX7Q2KHR2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RFX7Q2KHR2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RFX7Q2KHR2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RFX7Q2KHR2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RFX7Q2KHR2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RFX7Q2KHR2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
RFX7Q2KHR2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RFX7Q2KHR2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RFX7Q2KHR2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RFX7Q2KHR2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RFX7Q2KHR2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RFX7Q2KHR2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RFX7Q2KHR2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RFX7Q2KHR2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RFX7Q2KHR2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RFX7Q2KHR2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RFX7Q2KHR2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RFX7Q2KHR2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RFX7Q2KHR2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RFX7Q2KHR2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RFX7Q2KHR2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RFX7Q2KHR2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RFX7Q2KHR2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RFX7Q2KHR2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RFX7Q2KHR2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RFX7Q2KHR2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RFX7Q2KHR2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RFX7Q2KHR2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RFX7Q2KHR2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RFX7Q2KHR2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RFX7Q2KHR2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RFX7Q2KHR2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RFX7Q2KHR2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RFX7Q2KHR2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RFX7Q2KHR2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RFX7Q2KHR2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RFX7Q2KHR2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RFX7Q2KHR2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RFX7Q2KHR2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RFX7Q2KHR2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RFX7Q2KHR2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RFX7Q2KHR2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RFX7Q2KHR2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RFX7Q2KHR2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
RFX7Q2KHR2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RFX7Q2KHR2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RFX7Q2KHR2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RFX7Q2KHR2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RFX7Q2KHR2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RFX7Q2KHR2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RFX7Q2KHR2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RFX7Q2KHR2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RFX7Q2KHR2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RFX7Q2KHR2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RFX7Q2KHR2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RFX7Q2KHR2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RFX7Q2KHR2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RFX7Q2KHR2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RFX7Q2KHR2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RFX7Q2KHR2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RFX7Q2KHR2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RFX7Q2KHR2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RFX7Q2KHR2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms