Protein–RNA interactions for Protein: Q16650

TBR1, T-box brain protein 1, humanhuman

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Length 682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBR1Q16650 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TBR1Q16650 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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