Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
DDB1Q16531 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
DDB1Q16531 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
DDB1Q16531 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
DDB1Q16531 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
DDB1Q16531 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
DDB1Q16531 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
DDB1Q16531 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
DDB1Q16531 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
DDB1Q16531 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
DDB1Q16531 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
DDB1Q16531 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
DDB1Q16531 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
DDB1Q16531 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
DDB1Q16531 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
DDB1Q16531 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
DDB1Q16531 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC30■■■□□ 2.39
DDB1Q16531 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
DDB1Q16531 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
DDB1Q16531 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
DDB1Q16531 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
DDB1Q16531 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
DDB1Q16531 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
DDB1Q16531 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
DDB1Q16531 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
DDB1Q16531 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
DDB1Q16531 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
DDB1Q16531 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
DDB1Q16531 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
DDB1Q16531 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
DDB1Q16531 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
DDB1Q16531 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
DDB1Q16531 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
DDB1Q16531 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
DDB1Q16531 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
DDB1Q16531 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
DDB1Q16531 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
DDB1Q16531 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
DDB1Q16531 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
DDB1Q16531 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
DDB1Q16531 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
DDB1Q16531 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
DDB1Q16531 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
DDB1Q16531 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
DDB1Q16531 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
DDB1Q16531 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
DDB1Q16531 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
DDB1Q16531 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
DDB1Q16531 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
DDB1Q16531 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
DDB1Q16531 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
DDB1Q16531 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
DDB1Q16531 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
DDB1Q16531 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
DDB1Q16531 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
DDB1Q16531 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
DDB1Q16531 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
DDB1Q16531 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
DDB1Q16531 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
DDB1Q16531 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
DDB1Q16531 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
DDB1Q16531 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
DDB1Q16531 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
DDB1Q16531 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
DDB1Q16531 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
DDB1Q16531 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
DDB1Q16531 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
DDB1Q16531 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
DDB1Q16531 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
DDB1Q16531 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
DDB1Q16531 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
DDB1Q16531 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
DDB1Q16531 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
DDB1Q16531 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
DDB1Q16531 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
DDB1Q16531 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
DDB1Q16531 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
DDB1Q16531 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
DDB1Q16531 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
DDB1Q16531 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
DDB1Q16531 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
DDB1Q16531 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
DDB1Q16531 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
DDB1Q16531 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
DDB1Q16531 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
DDB1Q16531 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
DDB1Q16531 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
DDB1Q16531 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
DDB1Q16531 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
DDB1Q16531 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
DDB1Q16531 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
DDB1Q16531 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
DDB1Q16531 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
DDB1Q16531 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
DDB1Q16531 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
DDB1Q16531 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
DDB1Q16531 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
DDB1Q16531 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
DDB1Q16531 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
DDB1Q16531 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
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