Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
VPS72Q15906 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
VPS72Q15906 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
VPS72Q15906 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
VPS72Q15906 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
VPS72Q15906 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
VPS72Q15906 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
VPS72Q15906 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
VPS72Q15906 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
VPS72Q15906 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
VPS72Q15906 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
VPS72Q15906 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
VPS72Q15906 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
VPS72Q15906 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
VPS72Q15906 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
VPS72Q15906 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
VPS72Q15906 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
VPS72Q15906 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
VPS72Q15906 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
VPS72Q15906 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
VPS72Q15906 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
VPS72Q15906 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
VPS72Q15906 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
VPS72Q15906 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
VPS72Q15906 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
VPS72Q15906 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
VPS72Q15906 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
VPS72Q15906 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
VPS72Q15906 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
VPS72Q15906 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
VPS72Q15906 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
VPS72Q15906 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
VPS72Q15906 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
VPS72Q15906 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
VPS72Q15906 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
VPS72Q15906 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
VPS72Q15906 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
VPS72Q15906 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
VPS72Q15906 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
VPS72Q15906 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
VPS72Q15906 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
VPS72Q15906 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
VPS72Q15906 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
VPS72Q15906 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
VPS72Q15906 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
VPS72Q15906 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
VPS72Q15906 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
VPS72Q15906 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
VPS72Q15906 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
VPS72Q15906 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
VPS72Q15906 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
VPS72Q15906 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
VPS72Q15906 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
VPS72Q15906 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
VPS72Q15906 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
VPS72Q15906 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
VPS72Q15906 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
VPS72Q15906 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
VPS72Q15906 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
VPS72Q15906 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC30.32■■■□□ 2.44
VPS72Q15906 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
VPS72Q15906 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
VPS72Q15906 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
VPS72Q15906 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
VPS72Q15906 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
VPS72Q15906 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
VPS72Q15906 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
VPS72Q15906 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
VPS72Q15906 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
VPS72Q15906 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
VPS72Q15906 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
VPS72Q15906 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
VPS72Q15906 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
VPS72Q15906 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
VPS72Q15906 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
VPS72Q15906 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
VPS72Q15906 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
VPS72Q15906 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
VPS72Q15906 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
VPS72Q15906 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
VPS72Q15906 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
VPS72Q15906 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
VPS72Q15906 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
VPS72Q15906 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
VPS72Q15906 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
VPS72Q15906 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
VPS72Q15906 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
VPS72Q15906 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
VPS72Q15906 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
VPS72Q15906 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
VPS72Q15906 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC30.28■■■□□ 2.44
VPS72Q15906 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
VPS72Q15906 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
VPS72Q15906 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
VPS72Q15906 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
VPS72Q15906 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
VPS72Q15906 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
VPS72Q15906 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
VPS72Q15906 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
VPS72Q15906 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
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