Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA1EQ15878 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA1EQ15878 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA1EQ15878 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA1EQ15878 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA1EQ15878 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA1EQ15878 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA1EQ15878 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA1EQ15878 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA1EQ15878 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA1EQ15878 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA1EQ15878 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA1EQ15878 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA1EQ15878 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1EQ15878 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1EQ15878 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1EQ15878 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1EQ15878 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1EQ15878 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1EQ15878 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1EQ15878 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA1EQ15878 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA1EQ15878 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA1EQ15878 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA1EQ15878 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA1EQ15878 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA1EQ15878 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA1EQ15878 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms