Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMGN3Q15651 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HMGN3Q15651 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms