Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SURF1Q15526 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SURF1Q15526 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SURF1Q15526 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SURF1Q15526 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SURF1Q15526 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SURF1Q15526 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SURF1Q15526 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SURF1Q15526 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SURF1Q15526 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SURF1Q15526 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SURF1Q15526 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SURF1Q15526 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SURF1Q15526 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SURF1Q15526 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SURF1Q15526 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SURF1Q15526 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SURF1Q15526 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SURF1Q15526 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SURF1Q15526 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
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