Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCF4Q15080 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NCF4Q15080 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCF4Q15080 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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