Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
NFIXQ14938 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
NFIXQ14938 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NFIXQ14938 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NFIXQ14938 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NFIXQ14938 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NFIXQ14938 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NFIXQ14938 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NFIXQ14938 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NFIXQ14938 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NFIXQ14938 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NFIXQ14938 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NFIXQ14938 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NFIXQ14938 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NFIXQ14938 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NFIXQ14938 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NFIXQ14938 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NFIXQ14938 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NFIXQ14938 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NFIXQ14938 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NFIXQ14938 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NFIXQ14938 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NFIXQ14938 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NFIXQ14938 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NFIXQ14938 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NFIXQ14938 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NFIXQ14938 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NFIXQ14938 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
NFIXQ14938 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NFIXQ14938 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NFIXQ14938 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NFIXQ14938 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NFIXQ14938 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NFIXQ14938 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NFIXQ14938 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NFIXQ14938 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NFIXQ14938 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NFIXQ14938 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NFIXQ14938 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NFIXQ14938 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NFIXQ14938 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NFIXQ14938 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NFIXQ14938 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NFIXQ14938 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NFIXQ14938 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NFIXQ14938 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NFIXQ14938 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NFIXQ14938 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NFIXQ14938 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NFIXQ14938 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NFIXQ14938 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NFIXQ14938 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NFIXQ14938 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NFIXQ14938 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NFIXQ14938 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NFIXQ14938 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NFIXQ14938 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NFIXQ14938 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NFIXQ14938 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NFIXQ14938 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NFIXQ14938 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NFIXQ14938 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NFIXQ14938 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NFIXQ14938 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFIXQ14938 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
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