Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RRP1BQ14684 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRP1BQ14684 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRP1BQ14684 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRP1BQ14684 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRP1BQ14684 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RRP1BQ14684 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRP1BQ14684 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP1BQ14684 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP1BQ14684 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP1BQ14684 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP1BQ14684 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP1BQ14684 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP1BQ14684 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP1BQ14684 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP1BQ14684 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP1BQ14684 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP1BQ14684 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP1BQ14684 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP1BQ14684 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP1BQ14684 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP1BQ14684 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP1BQ14684 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP1BQ14684 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRP1BQ14684 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRP1BQ14684 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRP1BQ14684 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRP1BQ14684 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP1BQ14684 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP1BQ14684 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP1BQ14684 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP1BQ14684 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP1BQ14684 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP1BQ14684 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP1BQ14684 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRP1BQ14684 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRP1BQ14684 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRP1BQ14684 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRP1BQ14684 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRP1BQ14684 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RRP1BQ14684 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RRP1BQ14684 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RRP1BQ14684 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RRP1BQ14684 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRP1BQ14684 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRP1BQ14684 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRP1BQ14684 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRP1BQ14684 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRP1BQ14684 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRP1BQ14684 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRP1BQ14684 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
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