Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3AQ14563 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3AQ14563 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3AQ14563 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
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