Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
NEDD9Q14511 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEDD9Q14511 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
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