Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPRIN1Q14444 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
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