Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PKD2Q13563 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PKD2Q13563 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PKD2Q13563 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PKD2Q13563 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PKD2Q13563 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PKD2Q13563 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PKD2Q13563 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PKD2Q13563 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PKD2Q13563 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PKD2Q13563 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PKD2Q13563 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PKD2Q13563 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PKD2Q13563 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PKD2Q13563 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PKD2Q13563 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PKD2Q13563 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PKD2Q13563 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PKD2Q13563 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
PKD2Q13563 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PKD2Q13563 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PKD2Q13563 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PKD2Q13563 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PKD2Q13563 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PKD2Q13563 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PKD2Q13563 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PKD2Q13563 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PKD2Q13563 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PKD2Q13563 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PKD2Q13563 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
PKD2Q13563 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
PKD2Q13563 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PKD2Q13563 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PKD2Q13563 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PKD2Q13563 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PKD2Q13563 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PKD2Q13563 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PKD2Q13563 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PKD2Q13563 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PKD2Q13563 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PKD2Q13563 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PKD2Q13563 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PKD2Q13563 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PKD2Q13563 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PKD2Q13563 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PKD2Q13563 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
PKD2Q13563 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
PKD2Q13563 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PKD2Q13563 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PKD2Q13563 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PKD2Q13563 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PKD2Q13563 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PKD2Q13563 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PKD2Q13563 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PKD2Q13563 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PKD2Q13563 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PKD2Q13563 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PKD2Q13563 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PKD2Q13563 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PKD2Q13563 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PKD2Q13563 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PKD2Q13563 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PKD2Q13563 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PKD2Q13563 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PKD2Q13563 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PKD2Q13563 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PKD2Q13563 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PKD2Q13563 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PKD2Q13563 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PKD2Q13563 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PKD2Q13563 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PKD2Q13563 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PKD2Q13563 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
PKD2Q13563 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PKD2Q13563 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PKD2Q13563 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PKD2Q13563 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PKD2Q13563 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PKD2Q13563 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PKD2Q13563 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PKD2Q13563 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PKD2Q13563 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PKD2Q13563 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PKD2Q13563 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PKD2Q13563 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
PKD2Q13563 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PKD2Q13563 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PKD2Q13563 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PKD2Q13563 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PKD2Q13563 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
PKD2Q13563 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PKD2Q13563 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
PKD2Q13563 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
PKD2Q13563 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
PKD2Q13563 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
PKD2Q13563 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
PKD2Q13563 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
PKD2Q13563 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PKD2Q13563 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PKD2Q13563 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
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