Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
C1orf61Q13536 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf61Q13536 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
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