Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PICALMQ13492 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PICALMQ13492 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PICALMQ13492 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PICALMQ13492 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PICALMQ13492 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PICALMQ13492 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PICALMQ13492 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PICALMQ13492 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PICALMQ13492 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PICALMQ13492 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PICALMQ13492 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PICALMQ13492 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PICALMQ13492 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PICALMQ13492 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PICALMQ13492 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PICALMQ13492 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PICALMQ13492 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PICALMQ13492 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PICALMQ13492 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PICALMQ13492 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PICALMQ13492 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PICALMQ13492 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PICALMQ13492 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PICALMQ13492 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PICALMQ13492 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PICALMQ13492 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PICALMQ13492 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PICALMQ13492 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PICALMQ13492 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PICALMQ13492 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PICALMQ13492 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PICALMQ13492 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PICALMQ13492 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PICALMQ13492 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PICALMQ13492 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PICALMQ13492 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PICALMQ13492 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PICALMQ13492 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PICALMQ13492 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PICALMQ13492 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PICALMQ13492 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PICALMQ13492 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PICALMQ13492 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PICALMQ13492 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PICALMQ13492 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PICALMQ13492 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PICALMQ13492 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PICALMQ13492 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PICALMQ13492 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PICALMQ13492 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PICALMQ13492 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PICALMQ13492 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PICALMQ13492 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PICALMQ13492 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PICALMQ13492 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PICALMQ13492 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PICALMQ13492 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PICALMQ13492 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PICALMQ13492 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PICALMQ13492 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PICALMQ13492 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PICALMQ13492 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PICALMQ13492 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PICALMQ13492 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PICALMQ13492 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PICALMQ13492 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PICALMQ13492 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PICALMQ13492 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PICALMQ13492 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PICALMQ13492 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PICALMQ13492 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PICALMQ13492 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PICALMQ13492 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PICALMQ13492 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PICALMQ13492 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PICALMQ13492 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PICALMQ13492 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PICALMQ13492 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PICALMQ13492 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PICALMQ13492 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PICALMQ13492 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PICALMQ13492 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PICALMQ13492 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PICALMQ13492 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PICALMQ13492 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PICALMQ13492 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PICALMQ13492 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PICALMQ13492 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PICALMQ13492 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PICALMQ13492 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PICALMQ13492 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PICALMQ13492 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PICALMQ13492 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PICALMQ13492 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PICALMQ13492 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PICALMQ13492 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PICALMQ13492 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PICALMQ13492 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PICALMQ13492 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
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