Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMAD4Q13485 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMAD4Q13485 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMAD4Q13485 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMAD4Q13485 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMAD4Q13485 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMAD4Q13485 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMAD4Q13485 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMAD4Q13485 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SMAD4Q13485 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMAD4Q13485 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMAD4Q13485 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAD4Q13485 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAD4Q13485 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAD4Q13485 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAD4Q13485 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAD4Q13485 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAD4Q13485 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAD4Q13485 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMAD4Q13485 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMAD4Q13485 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMAD4Q13485 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMAD4Q13485 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMAD4Q13485 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SMAD4Q13485 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAD4Q13485 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAD4Q13485 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAD4Q13485 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAD4Q13485 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAD4Q13485 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAD4Q13485 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAD4Q13485 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAD4Q13485 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAD4Q13485 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAD4Q13485 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMAD4Q13485 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMAD4Q13485 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMAD4Q13485 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMAD4Q13485 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMAD4Q13485 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMAD4Q13485 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMAD4Q13485 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMAD4Q13485 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SMAD4Q13485 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMAD4Q13485 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMAD4Q13485 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMAD4Q13485 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMAD4Q13485 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SMAD4Q13485 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMAD4Q13485 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMAD4Q13485 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SMAD4Q13485 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMAD4Q13485 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMAD4Q13485 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMAD4Q13485 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMAD4Q13485 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMAD4Q13485 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
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