Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEMA3FQ13275 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEMA3FQ13275 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEMA3FQ13275 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEMA3FQ13275 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEMA3FQ13275 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEMA3FQ13275 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SEMA3FQ13275 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SEMA3FQ13275 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SEMA3FQ13275 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA3FQ13275 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA3FQ13275 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA3FQ13275 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA3FQ13275 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA3FQ13275 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA3FQ13275 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA3FQ13275 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA3FQ13275 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA3FQ13275 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA3FQ13275 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA3FQ13275 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEMA3FQ13275 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEMA3FQ13275 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEMA3FQ13275 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEMA3FQ13275 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEMA3FQ13275 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEMA3FQ13275 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEMA3FQ13275 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SEMA3FQ13275 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEMA3FQ13275 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEMA3FQ13275 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEMA3FQ13275 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA3FQ13275 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA3FQ13275 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA3FQ13275 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA3FQ13275 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA3FQ13275 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA3FQ13275 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA3FQ13275 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEMA3FQ13275 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEMA3FQ13275 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEMA3FQ13275 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEMA3FQ13275 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEMA3FQ13275 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEMA3FQ13275 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEMA3FQ13275 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEMA3FQ13275 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
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