Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RLFQ13129 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RLFQ13129 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RLFQ13129 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RLFQ13129 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RLFQ13129 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RLFQ13129 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RLFQ13129 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RLFQ13129 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RLFQ13129 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RLFQ13129 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RLFQ13129 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RLFQ13129 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RLFQ13129 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RLFQ13129 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RLFQ13129 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RLFQ13129 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RLFQ13129 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RLFQ13129 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RLFQ13129 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RLFQ13129 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RLFQ13129 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RLFQ13129 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RLFQ13129 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RLFQ13129 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RLFQ13129 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RLFQ13129 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RLFQ13129 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RLFQ13129 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RLFQ13129 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RLFQ13129 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RLFQ13129 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RLFQ13129 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RLFQ13129 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RLFQ13129 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RLFQ13129 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RLFQ13129 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RLFQ13129 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RLFQ13129 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RLFQ13129 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RLFQ13129 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RLFQ13129 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RLFQ13129 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RLFQ13129 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RLFQ13129 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RLFQ13129 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RLFQ13129 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RLFQ13129 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RLFQ13129 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RLFQ13129 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RLFQ13129 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RLFQ13129 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RLFQ13129 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RLFQ13129 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RLFQ13129 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RLFQ13129 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RLFQ13129 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RLFQ13129 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RLFQ13129 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RLFQ13129 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RLFQ13129 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RLFQ13129 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RLFQ13129 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RLFQ13129 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RLFQ13129 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RLFQ13129 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RLFQ13129 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RLFQ13129 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RLFQ13129 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RLFQ13129 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RLFQ13129 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RLFQ13129 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RLFQ13129 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RLFQ13129 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RLFQ13129 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RLFQ13129 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RLFQ13129 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RLFQ13129 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RLFQ13129 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RLFQ13129 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RLFQ13129 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RLFQ13129 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RLFQ13129 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RLFQ13129 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RLFQ13129 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RLFQ13129 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RLFQ13129 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RLFQ13129 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RLFQ13129 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RLFQ13129 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
RLFQ13129 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RLFQ13129 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RLFQ13129 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RLFQ13129 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RLFQ13129 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RLFQ13129 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RLFQ13129 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RLFQ13129 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RLFQ13129 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RLFQ13129 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms