Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT88Q13099 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
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