Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NFX1Q12986 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NFX1Q12986 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFX1Q12986 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
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