Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTP4A2Q12974 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
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