Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXD4Q12950 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXD4Q12950 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXD4Q12950 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FOXD4Q12950 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXD4Q12950 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXD4Q12950 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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FOXD4Q12950 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
FOXD4Q12950 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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