Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHD3Q12873 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHD3Q12873 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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