Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
ABCC8Q09428 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
ABCC8Q09428 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
ABCC8Q09428 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
ABCC8Q09428 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
ABCC8Q09428 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC39.22■■■■□ 3.87
ABCC8Q09428 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
ABCC8Q09428 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
ABCC8Q09428 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
ABCC8Q09428 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC39.21■■■■□ 3.87
ABCC8Q09428 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
ABCC8Q09428 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
ABCC8Q09428 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
ABCC8Q09428 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
ABCC8Q09428 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC39.21■■■■□ 3.87
ABCC8Q09428 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
ABCC8Q09428 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
ABCC8Q09428 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
ABCC8Q09428 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
ABCC8Q09428 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
ABCC8Q09428 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC39.2■■■■□ 3.87
ABCC8Q09428 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
ABCC8Q09428 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
ABCC8Q09428 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
ABCC8Q09428 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
ABCC8Q09428 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
ABCC8Q09428 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
ABCC8Q09428 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
ABCC8Q09428 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
ABCC8Q09428 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
ABCC8Q09428 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
ABCC8Q09428 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
ABCC8Q09428 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
ABCC8Q09428 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
ABCC8Q09428 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
ABCC8Q09428 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC39.18■■■■□ 3.86
ABCC8Q09428 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
ABCC8Q09428 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
ABCC8Q09428 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC39.17■■■■□ 3.86
ABCC8Q09428 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC39.17■■■■□ 3.86
ABCC8Q09428 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
ABCC8Q09428 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
ABCC8Q09428 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
ABCC8Q09428 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
ABCC8Q09428 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
ABCC8Q09428 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
ABCC8Q09428 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
ABCC8Q09428 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
ABCC8Q09428 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC39.15■■■■□ 3.86
ABCC8Q09428 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
ABCC8Q09428 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
ABCC8Q09428 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
ABCC8Q09428 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
ABCC8Q09428 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC39.14■■■■□ 3.86
ABCC8Q09428 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
ABCC8Q09428 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
ABCC8Q09428 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
ABCC8Q09428 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
ABCC8Q09428 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
ABCC8Q09428 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
ABCC8Q09428 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
ABCC8Q09428 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
ABCC8Q09428 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
ABCC8Q09428 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
ABCC8Q09428 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
ABCC8Q09428 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
ABCC8Q09428 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
ABCC8Q09428 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
ABCC8Q09428 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
ABCC8Q09428 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC39.12■■■■□ 3.85
ABCC8Q09428 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
ABCC8Q09428 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
ABCC8Q09428 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC39.11■■■■□ 3.85
ABCC8Q09428 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
ABCC8Q09428 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
ABCC8Q09428 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
ABCC8Q09428 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
ABCC8Q09428 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
ABCC8Q09428 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
ABCC8Q09428 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
ABCC8Q09428 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
ABCC8Q09428 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
ABCC8Q09428 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
ABCC8Q09428 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
ABCC8Q09428 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
ABCC8Q09428 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
ABCC8Q09428 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
ABCC8Q09428 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC39.08■■■■□ 3.85
ABCC8Q09428 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
ABCC8Q09428 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
ABCC8Q09428 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.85
ABCC8Q09428 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
ABCC8Q09428 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
ABCC8Q09428 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
ABCC8Q09428 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
ABCC8Q09428 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC39.06■■■■□ 3.84
ABCC8Q09428 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
ABCC8Q09428 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC39.05■■■■□ 3.84
ABCC8Q09428 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC39.05■■■■□ 3.84
ABCC8Q09428 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms