Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DDR1Q08345 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DDR1Q08345 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DDR1Q08345 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
DDR1Q08345 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DDR1Q08345 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DDR1Q08345 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DDR1Q08345 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DDR1Q08345 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDR1Q08345 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDR1Q08345 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDR1Q08345 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDR1Q08345 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDR1Q08345 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDR1Q08345 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDR1Q08345 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDR1Q08345 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDR1Q08345 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDR1Q08345 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDR1Q08345 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDR1Q08345 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DDR1Q08345 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DDR1Q08345 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DDR1Q08345 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DDR1Q08345 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DDR1Q08345 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
DDR1Q08345 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DDR1Q08345 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DDR1Q08345 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DDR1Q08345 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DDR1Q08345 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DDR1Q08345 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DDR1Q08345 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DDR1Q08345 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DDR1Q08345 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DDR1Q08345 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDR1Q08345 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
DDR1Q08345 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDR1Q08345 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDR1Q08345 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDR1Q08345 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDR1Q08345 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDR1Q08345 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDR1Q08345 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDR1Q08345 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDR1Q08345 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDR1Q08345 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDR1Q08345 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDR1Q08345 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDR1Q08345 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDR1Q08345 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDR1Q08345 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDR1Q08345 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDR1Q08345 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDR1Q08345 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDR1Q08345 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
DDR1Q08345 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDR1Q08345 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDR1Q08345 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDR1Q08345 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDR1Q08345 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDR1Q08345 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDR1Q08345 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDR1Q08345 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDR1Q08345 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
DDR1Q08345 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDR1Q08345 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
DDR1Q08345 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDR1Q08345 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDR1Q08345 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDR1Q08345 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDR1Q08345 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
DDR1Q08345 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDR1Q08345 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDR1Q08345 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDR1Q08345 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDR1Q08345 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDR1Q08345 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDR1Q08345 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDR1Q08345 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDR1Q08345 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDR1Q08345 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDR1Q08345 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDR1Q08345 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDR1Q08345 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDR1Q08345 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDR1Q08345 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDR1Q08345 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDR1Q08345 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms