Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PAX8Q06710 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAX8Q06710 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms