Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABPB1Q06547 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms