Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DEUP1Q05D60 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DEUP1Q05D60 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
DEUP1Q05D60 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DEUP1Q05D60 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DEUP1Q05D60 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DEUP1Q05D60 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DEUP1Q05D60 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DEUP1Q05D60 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DEUP1Q05D60 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DEUP1Q05D60 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DEUP1Q05D60 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DEUP1Q05D60 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DEUP1Q05D60 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DEUP1Q05D60 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DEUP1Q05D60 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DEUP1Q05D60 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DEUP1Q05D60 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DEUP1Q05D60 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DEUP1Q05D60 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DEUP1Q05D60 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
DEUP1Q05D60 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
DEUP1Q05D60 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
DEUP1Q05D60 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
DEUP1Q05D60 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DEUP1Q05D60 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DEUP1Q05D60 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DEUP1Q05D60 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DEUP1Q05D60 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DEUP1Q05D60 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DEUP1Q05D60 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DEUP1Q05D60 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DEUP1Q05D60 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DEUP1Q05D60 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DEUP1Q05D60 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DEUP1Q05D60 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DEUP1Q05D60 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DEUP1Q05D60 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DEUP1Q05D60 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DEUP1Q05D60 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DEUP1Q05D60 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DEUP1Q05D60 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DEUP1Q05D60 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DEUP1Q05D60 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DEUP1Q05D60 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DEUP1Q05D60 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DEUP1Q05D60 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DEUP1Q05D60 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DEUP1Q05D60 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DEUP1Q05D60 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DEUP1Q05D60 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DEUP1Q05D60 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DEUP1Q05D60 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DEUP1Q05D60 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DEUP1Q05D60 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DEUP1Q05D60 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DEUP1Q05D60 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DEUP1Q05D60 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DEUP1Q05D60 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DEUP1Q05D60 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DEUP1Q05D60 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DEUP1Q05D60 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DEUP1Q05D60 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DEUP1Q05D60 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DEUP1Q05D60 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DEUP1Q05D60 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DEUP1Q05D60 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DEUP1Q05D60 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DEUP1Q05D60 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DEUP1Q05D60 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DEUP1Q05D60 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DEUP1Q05D60 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DEUP1Q05D60 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DEUP1Q05D60 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DEUP1Q05D60 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DEUP1Q05D60 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DEUP1Q05D60 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DEUP1Q05D60 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DEUP1Q05D60 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DEUP1Q05D60 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DEUP1Q05D60 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DEUP1Q05D60 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms