Protein–RNA interactions for Protein: Q04695

KRT17, Keratin, type I cytoskeletal 17, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT17Q04695 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT17Q04695 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms