Protein–RNA interactions for Protein: Q03252

LMNB2, Lamin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB2Q03252 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMNB2Q03252 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMNB2Q03252 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMNB2Q03252 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMNB2Q03252 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMNB2Q03252 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMNB2Q03252 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMNB2Q03252 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LMNB2Q03252 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMNB2Q03252 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMNB2Q03252 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMNB2Q03252 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LMNB2Q03252 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMNB2Q03252 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMNB2Q03252 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMNB2Q03252 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMNB2Q03252 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LMNB2Q03252 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMNB2Q03252 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMNB2Q03252 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMNB2Q03252 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMNB2Q03252 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMNB2Q03252 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMNB2Q03252 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMNB2Q03252 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMNB2Q03252 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMNB2Q03252 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMNB2Q03252 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LMNB2Q03252 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMNB2Q03252 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMNB2Q03252 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LMNB2Q03252 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LMNB2Q03252 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LMNB2Q03252 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LMNB2Q03252 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms