Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPCQ03188 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPCQ03188 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms