Protein–RNA interactions for Protein: Q01453

PMP22, Peripheral myelin protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMP22Q01453 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PMP22Q01453 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PMP22Q01453 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PMP22Q01453 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PMP22Q01453 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PMP22Q01453 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PMP22Q01453 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PMP22Q01453 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PMP22Q01453 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PMP22Q01453 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PMP22Q01453 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PMP22Q01453 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PMP22Q01453 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PMP22Q01453 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PMP22Q01453 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PMP22Q01453 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PMP22Q01453 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PMP22Q01453 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PMP22Q01453 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PMP22Q01453 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PMP22Q01453 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PMP22Q01453 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PMP22Q01453 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PMP22Q01453 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PMP22Q01453 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PMP22Q01453 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PMP22Q01453 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PMP22Q01453 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms