Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1BQ00975 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1BQ00975 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1BQ00975 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1BQ00975 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1BQ00975 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1BQ00975 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1BQ00975 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1BQ00975 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1BQ00975 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1BQ00975 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1BQ00975 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1BQ00975 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1BQ00975 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1BQ00975 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1BQ00975 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1BQ00975 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1BQ00975 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1BQ00975 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1BQ00975 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1BQ00975 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1BQ00975 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1BQ00975 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1BQ00975 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1BQ00975 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1BQ00975 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1BQ00975 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1BQ00975 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA1BQ00975 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA1BQ00975 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA1BQ00975 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA1BQ00975 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA1BQ00975 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA1BQ00975 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA1BQ00975 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA1BQ00975 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms