Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NOMO3P69849 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NOMO3P69849 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NOMO3P69849 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NOMO3P69849 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NOMO3P69849 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NOMO3P69849 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NOMO3P69849 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NOMO3P69849 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NOMO3P69849 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NOMO3P69849 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NOMO3P69849 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NOMO3P69849 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NOMO3P69849 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NOMO3P69849 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NOMO3P69849 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NOMO3P69849 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NOMO3P69849 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NOMO3P69849 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NOMO3P69849 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NOMO3P69849 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NOMO3P69849 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOMO3P69849 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOMO3P69849 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOMO3P69849 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOMO3P69849 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOMO3P69849 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOMO3P69849 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOMO3P69849 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOMO3P69849 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOMO3P69849 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOMO3P69849 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NOMO3P69849 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NOMO3P69849 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NOMO3P69849 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms