Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHOBP62745 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHOBP62745 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHOBP62745 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHOBP62745 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHOBP62745 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHOBP62745 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHOBP62745 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOBP62745 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOBP62745 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOBP62745 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOBP62745 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOBP62745 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOBP62745 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOBP62745 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOBP62745 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOBP62745 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOBP62745 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOBP62745 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOBP62745 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOBP62745 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOBP62745 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOBP62745 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOBP62745 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOBP62745 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOBP62745 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOBP62745 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOBP62745 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOBP62745 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOBP62745 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOBP62745 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOBP62745 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOBP62745 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOBP62745 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOBP62745 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOBP62745 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOBP62745 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOBP62745 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOBP62745 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOBP62745 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOBP62745 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOBP62745 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOBP62745 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOBP62745 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOBP62745 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOBP62745 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOBP62745 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOBP62745 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHOBP62745 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOBP62745 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOBP62745 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOBP62745 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOBP62745 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOBP62745 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOBP62745 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOBP62745 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOBP62745 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOBP62745 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOBP62745 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOBP62745 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOBP62745 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOBP62745 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOBP62745 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOBP62745 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOBP62745 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOBP62745 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOBP62745 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHOBP62745 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHOBP62745 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHOBP62745 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHOBP62745 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHOBP62745 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHOBP62745 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHOBP62745 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHOBP62745 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHOBP62745 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHOBP62745 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHOBP62745 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHOBP62745 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHOBP62745 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHOBP62745 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHOBP62745 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHOBP62745 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHOBP62745 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHOBP62745 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHOBP62745 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHOBP62745 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHOBP62745 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHOBP62745 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHOBP62745 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RHOBP62745 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RHOBP62745 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RHOBP62745 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RHOBP62745 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHOBP62745 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHOBP62745 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHOBP62745 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHOBP62745 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHOBP62745 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHOBP62745 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms