Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LMO4P61968 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LMO4P61968 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LMO4P61968 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LMO4P61968 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LMO4P61968 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
LMO4P61968 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LMO4P61968 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LMO4P61968 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LMO4P61968 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LMO4P61968 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LMO4P61968 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LMO4P61968 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LMO4P61968 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LMO4P61968 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
LMO4P61968 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
LMO4P61968 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LMO4P61968 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LMO4P61968 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LMO4P61968 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LMO4P61968 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
LMO4P61968 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LMO4P61968 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LMO4P61968 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LMO4P61968 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LMO4P61968 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LMO4P61968 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LMO4P61968 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LMO4P61968 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LMO4P61968 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LMO4P61968 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LMO4P61968 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LMO4P61968 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LMO4P61968 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LMO4P61968 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LMO4P61968 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LMO4P61968 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LMO4P61968 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMO4P61968 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMO4P61968 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMO4P61968 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMO4P61968 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LMO4P61968 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMO4P61968 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMO4P61968 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMO4P61968 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMO4P61968 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LMO4P61968 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LMO4P61968 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LMO4P61968 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMO4P61968 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMO4P61968 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMO4P61968 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMO4P61968 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMO4P61968 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMO4P61968 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LMO4P61968 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LMO4P61968 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMO4P61968 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMO4P61968 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMO4P61968 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMO4P61968 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMO4P61968 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMO4P61968 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMO4P61968 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMO4P61968 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMO4P61968 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMO4P61968 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMO4P61968 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMO4P61968 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMO4P61968 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LMO4P61968 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMO4P61968 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMO4P61968 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMO4P61968 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMO4P61968 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMO4P61968 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMO4P61968 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMO4P61968 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMO4P61968 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMO4P61968 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LMO4P61968 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LMO4P61968 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMO4P61968 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMO4P61968 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMO4P61968 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMO4P61968 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMO4P61968 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMO4P61968 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMO4P61968 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMO4P61968 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMO4P61968 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMO4P61968 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMO4P61968 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMO4P61968 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LMO4P61968 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMO4P61968 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMO4P61968 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMO4P61968 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO4P61968 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms