Protein–RNA interactions for Protein: P61966

AP1S1, AP-1 complex subunit sigma-1A, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S1P61966 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AP1S1P61966 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP1S1P61966 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AP1S1P61966 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AP1S1P61966 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AP1S1P61966 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP1S1P61966 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP1S1P61966 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP1S1P61966 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP1S1P61966 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP1S1P61966 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP1S1P61966 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP1S1P61966 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP1S1P61966 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP1S1P61966 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP1S1P61966 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP1S1P61966 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP1S1P61966 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP1S1P61966 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP1S1P61966 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
AP1S1P61966 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP1S1P61966 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP1S1P61966 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP1S1P61966 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP1S1P61966 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP1S1P61966 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP1S1P61966 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
AP1S1P61966 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP1S1P61966 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP1S1P61966 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP1S1P61966 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms