Protein–RNA interactions for Protein: P57727

TMPRSS3, Transmembrane protease serine 3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS3P57727 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMPRSS3P57727 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMPRSS3P57727 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMPRSS3P57727 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMPRSS3P57727 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMPRSS3P57727 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMPRSS3P57727 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMPRSS3P57727 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMPRSS3P57727 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPRSS3P57727 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPRSS3P57727 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPRSS3P57727 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPRSS3P57727 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPRSS3P57727 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPRSS3P57727 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPRSS3P57727 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPRSS3P57727 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPRSS3P57727 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPRSS3P57727 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPRSS3P57727 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPRSS3P57727 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPRSS3P57727 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMPRSS3P57727 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMPRSS3P57727 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMPRSS3P57727 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMPRSS3P57727 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMPRSS3P57727 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMPRSS3P57727 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMPRSS3P57727 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
TMPRSS3P57727 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
TMPRSS3P57727 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMPRSS3P57727 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms