Protein–RNA interactions for Protein: P55209

NAP1L1, Nucleosome assembly protein 1-like 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L1P55209 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NAP1L1P55209 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NAP1L1P55209 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NAP1L1P55209 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NAP1L1P55209 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NAP1L1P55209 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NAP1L1P55209 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NAP1L1P55209 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NAP1L1P55209 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NAP1L1P55209 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NAP1L1P55209 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NAP1L1P55209 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NAP1L1P55209 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NAP1L1P55209 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NAP1L1P55209 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NAP1L1P55209 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NAP1L1P55209 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NAP1L1P55209 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NAP1L1P55209 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NAP1L1P55209 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NAP1L1P55209 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NAP1L1P55209 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NAP1L1P55209 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NAP1L1P55209 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NAP1L1P55209 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NAP1L1P55209 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NAP1L1P55209 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NAP1L1P55209 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NAP1L1P55209 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NAP1L1P55209 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NAP1L1P55209 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NAP1L1P55209 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NAP1L1P55209 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NAP1L1P55209 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NAP1L1P55209 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NAP1L1P55209 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NAP1L1P55209 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms