Protein–RNA interactions for Protein: P54840

GYS2, Glycogen [starch] synthase, liver, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYS2P54840 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GYS2P54840 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GYS2P54840 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GYS2P54840 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GYS2P54840 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GYS2P54840 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GYS2P54840 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GYS2P54840 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GYS2P54840 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GYS2P54840 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GYS2P54840 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GYS2P54840 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GYS2P54840 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GYS2P54840 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GYS2P54840 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GYS2P54840 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GYS2P54840 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GYS2P54840 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GYS2P54840 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GYS2P54840 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GYS2P54840 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GYS2P54840 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GYS2P54840 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GYS2P54840 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GYS2P54840 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GYS2P54840 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GYS2P54840 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GYS2P54840 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GYS2P54840 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GYS2P54840 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GYS2P54840 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GYS2P54840 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GYS2P54840 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GYS2P54840 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GYS2P54840 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GYS2P54840 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GYS2P54840 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GYS2P54840 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GYS2P54840 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GYS2P54840 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GYS2P54840 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GYS2P54840 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GYS2P54840 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GYS2P54840 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GYS2P54840 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GYS2P54840 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GYS2P54840 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GYS2P54840 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GYS2P54840 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GYS2P54840 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GYS2P54840 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GYS2P54840 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GYS2P54840 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GYS2P54840 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GYS2P54840 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GYS2P54840 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GYS2P54840 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GYS2P54840 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GYS2P54840 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GYS2P54840 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GYS2P54840 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GYS2P54840 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GYS2P54840 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GYS2P54840 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GYS2P54840 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GYS2P54840 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GYS2P54840 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GYS2P54840 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GYS2P54840 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GYS2P54840 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GYS2P54840 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GYS2P54840 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GYS2P54840 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GYS2P54840 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GYS2P54840 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GYS2P54840 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GYS2P54840 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GYS2P54840 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GYS2P54840 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GYS2P54840 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GYS2P54840 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GYS2P54840 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GYS2P54840 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GYS2P54840 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GYS2P54840 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GYS2P54840 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GYS2P54840 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GYS2P54840 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GYS2P54840 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GYS2P54840 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GYS2P54840 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GYS2P54840 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GYS2P54840 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GYS2P54840 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GYS2P54840 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GYS2P54840 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GYS2P54840 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GYS2P54840 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GYS2P54840 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
GYS2P54840 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms