Protein–RNA interactions for Protein: P53667

LIMK1, LIM domain kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK1P53667 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIMK1P53667 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LIMK1P53667 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIMK1P53667 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIMK1P53667 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIMK1P53667 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIMK1P53667 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIMK1P53667 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIMK1P53667 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIMK1P53667 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIMK1P53667 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIMK1P53667 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIMK1P53667 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIMK1P53667 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIMK1P53667 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIMK1P53667 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIMK1P53667 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIMK1P53667 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIMK1P53667 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIMK1P53667 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIMK1P53667 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIMK1P53667 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIMK1P53667 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIMK1P53667 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIMK1P53667 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIMK1P53667 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIMK1P53667 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms