Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACLYP53396 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACLYP53396 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ACLYP53396 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACLYP53396 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACLYP53396 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACLYP53396 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACLYP53396 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ACLYP53396 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ACLYP53396 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ACLYP53396 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ACLYP53396 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ACLYP53396 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ACLYP53396 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACLYP53396 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACLYP53396 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ACLYP53396 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ACLYP53396 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACLYP53396 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACLYP53396 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACLYP53396 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACLYP53396 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACLYP53396 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACLYP53396 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACLYP53396 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACLYP53396 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACLYP53396 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACLYP53396 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACLYP53396 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACLYP53396 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ACLYP53396 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACLYP53396 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ACLYP53396 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACLYP53396 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACLYP53396 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACLYP53396 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACLYP53396 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACLYP53396 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACLYP53396 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACLYP53396 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACLYP53396 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACLYP53396 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACLYP53396 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACLYP53396 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACLYP53396 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACLYP53396 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACLYP53396 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACLYP53396 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACLYP53396 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACLYP53396 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACLYP53396 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACLYP53396 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACLYP53396 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACLYP53396 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ACLYP53396 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACLYP53396 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACLYP53396 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACLYP53396 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACLYP53396 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACLYP53396 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ACLYP53396 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACLYP53396 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACLYP53396 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACLYP53396 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACLYP53396 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACLYP53396 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACLYP53396 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACLYP53396 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACLYP53396 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACLYP53396 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACLYP53396 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACLYP53396 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ACLYP53396 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACLYP53396 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACLYP53396 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACLYP53396 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACLYP53396 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACLYP53396 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACLYP53396 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACLYP53396 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACLYP53396 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACLYP53396 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACLYP53396 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACLYP53396 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACLYP53396 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACLYP53396 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ACLYP53396 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACLYP53396 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACLYP53396 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACLYP53396 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ACLYP53396 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACLYP53396 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACLYP53396 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACLYP53396 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACLYP53396 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACLYP53396 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACLYP53396 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACLYP53396 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACLYP53396 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACLYP53396 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms